寧衛健疾控〔2021〕308號
各縣區衛健局，西寧市疾病預防控制中心：
??? 現將《西寧市致病菌識別網監測方案》印發給你們，請各地區、各單位遵照執行。
西寧市衛生健康委員會
2021年6月25日
?
（信息公開形式:主動公開）
西寧市致病菌識別網監測方案
為規范、有序開展基于國家致病菌識別網的細菌性傳染病監測和持續建設工作，全面提高我市細菌性傳染病病原學監測工作質量和水平，加強網絡實驗室能力建設，結合我市實際情況，特制定本方案。
一、監測目的
加強疾控系統病原檢測鑒定和分析能力，開展系統化的實驗室監測和分析，掌握病原特征和流行態勢，提升暴發疫情預警和應急處置中“一錘定音”能力，為細菌性傳染病疫情分析和防控決策提供科學依據。
二、監測內容和工作要求
（一）針對重要的細菌性傳染病，開展標本采集、分離鑒定和實驗室分析，獲得連續性病原學監測數據。
1.監測范圍
（1）法定傳染病種及其病原菌
①腸道傳染病病原菌：霍亂弧菌、傷寒和副傷寒沙門菌、志賀菌、其他感染性腹瀉病原菌（非傷寒沙門菌、產腸毒素及志賀類毒素的大腸埃希菌、空腸彎曲菌、副溶血弧菌、小腸結腸炎耶爾森菌等）。
②呼吸道傳染病病原菌：腦膜炎奈瑟菌、A組溶血性鏈球菌（猩紅熱）等。
③自然疫源性傳染病病原菌：炭疽芽胞桿菌等。
（2）各地區根據本地流行和新發傳染病實際情況，擴展的其他致病菌，以及其他引起公共衛生問題的致病菌，例如軍團菌、萊姆病螺旋體、鉤端螺旋體、豬鏈球菌、類鼻疽伯克霍爾德菌、單增李斯特菌等。
2.監測時間和方式
（1）常規監測：針對監測的傳染病，西寧市參比實驗室根據本市實際情況，開展常規監測，設置監測哨點，采集標本，按要求開展病原學分析，積累和獲取連續性監測數據。該項工作納入疾控系統日常工作，全年開展。
（2）專題監測：國家中心實驗室根據上一年監測情況或當年新發突發傳染病的情況，布置專題監測任務，發布監測實施方案，遴選網絡實驗室和哨點，針對特定致病菌開展專題實驗室監測，獲得代表性監測數據。該項工作進行專題設計，部分區域定期開展。
3.監測點設置
根據《關于加強公共衛生體系建設和重大疫情防控救治體系建設工作的通知》以及《國家致病菌識別網監測和能力建設方案》選定西寧市疾控中心為區域參比實驗室。醫療機構/疾控中心選定西寧市第一人民醫院、西寧市第二人民醫院、西寧市第三人民醫院、湟中區第一人民醫院、大通縣醫院作為監測哨點醫院。疾控中心選定城西區疾控中心、城東區疾控中心、城中區疾控中心、城北區疾控中心、湟源縣疾控中心、湟中區疾控中心、大通縣疾控中心為監測點，按要求開展致病菌識別網監測工作（見附表1）。
附表1
致病菌識別網細菌性傳染病監測哨點醫院/疾控中心
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哨點醫院名稱
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疾控中心收集和轉運
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份?數
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腸道傳染病標本
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呼吸道傳染病標本
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西寧市第一人民醫院
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城中區疾控中心
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300
|
180
|
120
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|
西寧市第二人民醫院
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城北區疾控中心
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300
|
180
|
120
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|
西寧市第三人民醫院
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城北區疾控中心
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200
|
120
|
80
|
|
湟中區醫院
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湟中區疾控中心
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100
|
?60
|
40
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|
大通縣醫院
|
大通縣疾控中心
|
100
|
?60
|
40
|
??5.標本采集、菌株分離培養和收集
（1）標本采集和致病菌分離培養：
監測哨點醫院每年完成標本采集1000份，其中腸道傳染病標本不得少于600份、呼吸道傳染病標本不得少于400份，標本總數不得少于1000份，詳細要求如下：
①腸道傳染病標本（不少于600份）：
采集每日腹瀉三次及以上、并伴糞便性狀改變的門診就診病例急性期糞便標本，進行致病菌分離培養。致病菌種類根據轄區內往年分離情況自行選擇，不得少于3種，且在制定年度工作任務后可在年中增加菌種種類，但不能減少。
②呼吸道傳染病標本（不少于400份）：
采集表現咽痛、粟粒樣皮疹、楊梅舌、伴或不伴發熱的就診病例咽拭子標本，進行A組溶血性鏈球菌的分離鑒定（猩紅熱病例），腦膜炎奈瑟菌等呼吸道傳染病標本進行致病菌分離培養。
③采集炭疽芽胞桿菌等人獸共患傳染病標本進行致病菌分離培養。
（2）菌株收集
監測哨點醫院菌株收集來源包括：
上述腸道傳染病、呼吸道傳染病、人獸共患病標本采集后分離的病原菌。
各哨點醫院和監測點分離的傳染病相關致病菌在2個工作日內上送至市疾控參比實驗室，具體包括：霍亂弧菌、炭疽芽胞桿菌、傷寒副傷寒沙門菌、志賀菌、O157:H7大腸埃希菌、萊姆病螺旋體、鉤端螺旋體、豬鏈球菌、類鼻疽伯克霍爾德菌、單增李斯特菌、鳥-胞內分枝桿菌復合群。
突發傳染病疫情調查涉及的致病菌。
（3）陽性菌株的保存
??各哨點醫院和區縣疾控中心實驗室培養的傳染病相關致病菌菌株應接種到磁珠凍存管保存（可保存在-20℃冰箱）或軟瓊脂培養基（軟瓊脂培養基應盡快送檢），軟瓊脂培養基需培養18—24小時后，保存在2℃—8℃冰箱中。
6.標本（菌株）轉運
各轄區內所有臨床醫療機構實驗室分離的傳染病相關致病菌在2個工作日內由區縣疾病預防控制中心收集送至區域參比實驗室(西寧市疾控中心)，標本送檢應當按照《中華人民共和國傳染病防治法》、《病原微生物實驗室生物安全管理條例》、《可感染人類的高致病性病原微生物菌（毒）種或樣本運輸管理規定》和《人間傳染的病原微生物菌（毒）種保藏機構管理辦法》相關要求進行。
7.西寧市疾控參比實驗室分析和結果填報
完成菌株鑒定、分子分型、耐藥檢測、全基因組測序等實驗室分析工作。
（1）市參比實驗室負責復核哨點醫院和/或區縣級疾控采集和運送的標本（菌株），并及時進行菌株分離培養鑒定、基本病原學特征分析和進行目標菌分離鑒定和血清型/生物型/生化型的實驗分析，按照不同病原菌的常規培養鑒定方法進行。分離培養鑒定工作在接受標本（菌株）后立即開展（標本儲藏會影響分離率）。
（2）耐藥性檢測
每年完成至少100株致病菌的耐藥性檢測。開展耐藥性檢測的菌種類型包括：霍亂弧菌、沙門菌、志賀菌、大腸埃希菌、彎曲菌、副溶血弧菌、腦膜炎奈瑟菌等。?
（3）分子分型分析
每年完成至少100株致病菌的分子分型。不同病原細菌種或型，采用不同的分子分型方法，主要包括脈沖場凝膠電泳（PFGE）、多位點可變數目串聯重復序列分析（MLVA）、多位點序列分型（MLST）等，參比實驗室按照國家致病菌識別網標準操作規程開展致病菌分子分型實驗和分析。分子分型分析需在獲得菌株后2周內完成并在“國家致病菌識別網實驗室監測信息系統”中填報數據。
（4）全基因組測序
參比實驗室每年完成至少100株致病菌的全基因組測序（沒有能力的單位將菌株送至省疾控中心進行測序）。完成菌株的全基因組序列框架圖測定，測序分析需在獲得菌株后3個月內完成并在“國家致病菌識別網實驗室監測信息系統”中填報數據。
（5）結果填報
按照國家致病菌識別網信息管理要求，及時準確填報“國家致病菌識別網實驗室監測信息系統”。
8.省級中心實驗室
（1）收集并保藏本省致病菌識別網監測陽性菌株，每省全年收集保存不少于平均每地市50株陽性菌株。
（2）完成市州級網絡實驗室陽性菌株的抽樣復核工作，包括復核鑒定、耐藥性檢測、分子分型、全基因組測序，所有復核任務均勻至每季度進行。
（3）數據審核
按照國家致病菌識別網信息管理要求，審核轄區內地市級網絡實驗室填報“國家致病菌識別網實驗室監測信息系統”和分析結果的完整性、準確性。
（4）負責實驗室分析技術現場指導、協助提高各實驗室技術能力，省級室間實驗室質量控制考核工作。
（5）組織對網絡實驗室的質控考核工作。
（二）針對細菌性傳染病暴發疫情，應用實驗室檢測監測技術提供系統化支持，快速識別病原，追蹤溯源。
1.原則
實驗室工作人員與流行病學和現場人員協作，積極參與疫情調查處置，共同完成采集標本、記錄疫情相關信息，實時開展致病菌的實驗室分析，發揮“一錘定音”的作用，快速識別病原菌，獲取病原菌特征，共享所有實驗室分析結果，開展疫情分析討論，發現和發生發展規律，及時阻斷傳播路徑，追蹤傳染來源，防止疫情發展和蔓延。
2.事件類型
（1）在實驗室監測工作中，短時期內（定義為1個月）出現致病菌的分子分型或基因組特征相近的病例數量超過3個或以上，定義為分子分型預警事件，開展追蹤溯源調查。
（2）流行病學定義的細菌性傳染病暴發疫情，提供系統化實驗室支持。
3.標本采集與運送
由疫情發生地的疾控中心組織疫情標本的采集和運送，包括醫療機構中的病例標本采集、傳播可能因素調查中采集的標本，運送至西寧市疾控中心參比實驗室或省級實驗室。
4.實驗室分析
由西寧市參比實驗室或省級實驗室完成病原細菌分離鑒定、耐藥檢測和分子分型以及全基因組測序分析。其中病原細菌分離培養鑒定按照不同病原菌的常規培養鑒定方法進行，耐藥檢測和分子分型以及全基因組測序分析按照《國家致病菌識別網實驗室技術手冊》開展，及時完成。
5.結果報送
（1）?實驗室分析結果與流行病學人員共享，開展疫情分析討論。
（2）實驗室分析結果按要求填報國家致病菌識別網信息系統。
（3）參比實驗室以專題報告方式上報省疾控中心實驗室及國家中心實驗室。
三、組織管理與職責分工
國家致病菌識別網由各級衛生行政部門和業務實施單位組成。業務實施單位由各級疾控中心和網底機構組成。按照統一部署、分級管理、分類指導的原則，科學有序的開展細菌性傳染病監測工作。
（一）衛生行政部門?
國家衛健委負責管理國家致病菌識別網的建設和運行，組織編制和發布監測工作指導方案，定期組織督導考核，通報國家致病菌識別網監測工作進展。
省級、市級、區縣級衛生計生行政部門負責組織、協調、督導和評估本轄區的識別網監測工作，為識別網工作提供必需的政策和經費支持。組織編制和發布轄區致病菌識別網監測工作方案。每年定期組織對本轄區識別網的先進單位和先進個人進行表彰。
（二）中國疾病預防控制中心
1.負責國家致病菌識別網監測工作的具體組織和協調，制定監測工作相關技術文件；負責全國監測工作的技術培訓和指導，開展國家致病菌識別網的督導、考核和評估工作；組織和實施對省級網絡實驗室的評估工作。
2.負責建立國家致病菌識別網質量控制體系，組織對省級網絡實驗室的質控考核工作。
3.負責對暴發疫情處置的實驗室分析和指導，對各省級中心實驗室上送的特殊標本和菌株進行復核鑒定。
4.負責建設、運行和維護信息管理系統，強化信息安全。
5.定期分析和反饋全國監測數據，編發全國網絡監測月報。
（三）省級疾病預防控制中心
1.負責本省識別網監測工作的具體組織實施和協調，開展識別網實驗室監測工作，開展相關技術培訓和指導；負責本省致病菌識別網監測工作的督導、考核和評估工作。
2.負責開展和實施質量控制工作，組織對本省地市級網絡實驗室的質控考核工作。?
3.負責本省暴發疫情處置的實驗室分析和指導；負責本省內地市級網絡實驗室陽性菌株的收集、符合鑒定和結果反饋。
4.按照要求上送特殊標本和陽性菌株至國家中心實驗室進行復核。
5.每月對本省識別網監測數據進行分析和反饋，并以月報形式報送省級衛生行政部門，同時報送國家中心實驗室（電子郵箱：chinapin@icdc.cn）。
（四）市級疾病預防控制中心
1.負責本地市識別網監測工作的具體組織、實施和協調，分配足額從事識別網工作的人員；開展識別網實驗室監測工作，負責本地市網底機構細菌性傳染病監測和暴發處置的實驗室技術培訓和指導。
2.開展標本和菌株分離，鑒定轄區網底機構上送的菌株，按監測工作要求開展實驗室分析工作，及時填報反饋結果。
3.按要求上送陽性菌株至省級疾控中心進行復核。
4.每月對本地市識別網監測數據進行分析和反饋，以月報形式報送地市級衛生行政部門，并報上級疾控中心。
（五）網底機構
?1.縣區級疾控中心
（1）縣區級疾控中心負責收集和轉運哨點醫院采集的相關生物標本和陽性菌株至上級疾控中心。
（2）獲取基本流行病學信息，核實信息完整性，報送信息數據至上級疾控中心（見附表2.3）。
（3）協助上級疾控中心開展轄區傳染病暴發疫情的調查處置。
2.哨點醫療機構
（1）指定專門科室和人員負責致病菌識別網監測工作。
（2）按照監測方案要求，做好生物標本采集與保存工作。
（3）按照監測方案要求，充分利用醫院HIS系統，做好標本相關信息登記工作（見附表2.3）。
（4）發生傳染病暴發疫情時，協助完成相關的病例調查工作。
（5）接受轄區疾控中心在識別網監測工作方面的技術指導和培訓，接受衛生行政機構的督導、考核和評估。
四、生物安全要求
監測工作過程中，有關標本和菌株的采集、轉運、保藏及實驗室分析等各項活動均應遵守國家相應生物安全管理規定。
五、信息安全和管理
（一）國家致病菌識別網信息系統管理
各網絡實驗室（疾病預防控制中心）的賬號由系統管理員建立和維護，系統權限由業務管理員設置。
（二）網絡信息安全
各網絡成員單位要按照國家相關信息安全法規和本機構信息安全管理規定，管理和保障致病菌識別網的信息安全。?
六、培訓、考核和督導
（一）培訓
省級中心實驗室每年組織對本省份的網絡實驗室人員的培訓，區域參比實驗室協助完成本省的技術培訓。各網絡實驗室可選派專業技術人員至省級中心實驗室或國家中心實驗室進修。
根據致病菌識別網工作需求，國家中心實驗室和省級中心實驗室可派出專家對部分網絡實驗室所在疾病預防控制中心技術人員進行現場培訓和指導。
（二）技術考核和工作評估
1.技術考核
（1）組織形式
考核分為國家級考核和省級考核。
國家級考核由國家疾控中心組織開展省級中心實驗室及轄區內網絡實驗室參加的網絡工作考核。
省級考核由省級疾控中心組織開展轄區內網絡實驗室參加的網絡工作考核。
國家級考核每年執行一次，在次年年初進行。省級考核應在國家級考核之前進行。
（2）考核內容
①盲樣考核：省級中心實驗室負責組織本省市州級網絡實驗室的盲樣考核。國家中心實驗室向省級網絡實驗室分發菌株和樣品，開展盲樣考核，內容包括細菌鑒定、耐藥性檢測和分子分型以及實驗結果反饋及時性、信息網絡傳輸及時性等方面
②任務考核：及時準確完成內容與工作要求中的監測分析任務規定的菌株數量要求，完成率達到100%；菌株鑒定、耐藥檢測和分子分型等實驗均在規定時間內完成，時效率大于90%；信息記錄完整，均提交識別網中心數據庫，完整率達到大于90%。
2.工作評估
省級疾控中心參照國家評估方案，制訂本省份的考評估案。每年組織對網絡實驗室所在的地市或縣區級疾病預防控制中心、哨點醫院的工作進行評估，并將結果報送省級衛生行政部門，由省級衛生行政部門通報各市級衛生行政部門。???
（三）督導
1.省級督導
省級衛生行政部門每年組織對本轄區部分網絡實驗室及哨點醫院進行督導檢查，及時發現問題，提出解決方案，并將督導報告上報國家衛生健康委及中國疾病預防控制中心備案。
2.市州級督導
市州級衛生行政部門負責本轄區區縣級實驗室及哨點醫院的日常督導，每年督導2次或以上。
附表2
國家致病菌識別網-病原菌樣本信息登記表
一、?樣本信息
1.1樣本編號*：??????????
1.2采樣時間*：??????????
1.3樣本來源地*：??省??市??縣??
1.4樣本歸類*：□人;?(若樣本歸類為人，請填寫1.5)???□?動物;?(若樣本歸類為動物，請填寫1.6)??
□食品;?(若樣本歸類為動物，請填寫1.7)?R?環境(若樣本歸類為環境，請填寫1.8)??
□其他?(若樣本歸類為動物，請填寫1.9)
1.5?樣本來源：?□病人；?□健康人；?□攜帶人
樣本名稱*：□滲漏液：???□前列腺分泌物；??□肌腱膿液；??□纖支鏡吸痰；?
□氣管內痰；??□臍部分泌物；???□大腿穿刺液
患者姓名：??????????（聯系人姓名：???????????）
性別*：?男????女
民族：?????????????????
病歷號：????????????????
身份證號碼：??????????????
監測類型*：??腹瀉相關；?????呼吸道相關-百日咳；????呼吸道相關-猩紅熱；?????
?呼吸道相關-其他；??自然疫源相關；??????暴發監測
??分離狀態*：??分離成功；???分離失敗；???未分離；????鸚鵡熱源衣原體陽性
1.6樣本來源*：??家禽；???家畜；???野生動物
??樣本名稱*：??????
來源詳情：???????
監測類型*：??皮毛；????肉；????臟器；????其他??????
分離狀態*：??分離成功；??分離失敗；?未分離；???鸚鵡熱源衣原體陽性
1.7樣本來源*：??食品加工品；?食用油、油脂及其他制品；?肉制品；
?乳制品；???其他???????
樣本名稱*：???????
來源詳情：???????
監測類型*：??腹瀉相關；?????呼吸道相關-百日咳；????呼吸道相關-猩紅熱；?????
?呼吸道相關-其他；??自然疫源相關；??????暴發監測
分離狀態*：??分離成功；???分離失敗；???未分離；????鸚鵡熱源衣原體陽性
1.8樣本來源*：??考核樣：????質控菌株；???土壤；?????水；
??其他????????
樣本名稱*：??????
來源詳情：???????
監測類型*：??腹瀉相關；?????呼吸道相關-百日咳；????呼吸道相關-猩紅熱；?????
?呼吸道相關-其他；??自然疫源相關；??????暴發監測
??分離狀態*：??分離成功；???分離失敗；???未分離；????鸚鵡熱源衣原體陽性
1.9監測類型*：??腹瀉相關；?????呼吸道相關-百日咳；????呼吸道相關-猩紅熱；?????
?呼吸道相關-其他；??自然疫源相關；??????暴發監測
??分離狀態*：??分離成功；???分離失敗；???未分離；????鸚鵡熱源衣原體陽性
附表3
國家致病菌識別網-病原菌菌株信息登記表
一、?樣本信息
1.1樣本編號*：??????????
1.2采樣時間*：??????????
1.3樣本來源地*：??省??市??縣??
1.4樣本歸類*：□人;?(若樣本歸類為人，請填寫1.5)???□?動物;?(若樣本歸類為動物，請填寫1.6)??
□食品;?(若樣本歸類為動物，請填寫1.7)?R?環境(若樣本歸類為環境，請填寫1.8)??
1.5?樣本來源：?□病人；?□健康人；?□攜帶人
樣本名稱*：□滲漏液：???□前列腺分泌物；??□肌腱膿液；??□纖支鏡吸痰；?
□氣管內痰；??□臍部分泌物；???□大腿穿刺液
1.6樣本名稱*：??????
樣本來源*：??家禽；???家畜；???野生動物
??監測類型*：??皮毛；????肉；????臟器；????其他??????
1.7樣本名稱*：???????
樣本來源*：??食品加工品；?食用油、油脂及其他制品；?肉制品；
?乳制品；???其他???????
1.8樣本名稱*：??????
樣本來源*：??考核樣：???質控菌株；???土壤；?????水；
??其他????????
二、?菌株信息
1.1菌株種類*：????????
1.2菌株編號*：????????
1.3提交時間*：????????
1.4是否完成指紋圖譜實驗（PFGE）及指紋圖譜實驗的類型：?是；???否???
指紋圖譜實驗的類型：????????
1.5是否完成字符實驗（MLST）及字符實驗的類型：?是；???否???
字符實驗的類型：?????????
1.6是否完成耐藥實驗（MIC）及耐藥實驗的類型：?是；???否???
耐藥實驗的類型：?????????
1.7是否完成全基因組測序實驗：?是；???否???
1.8是否完成分子分型實驗：?是；???否
1.9?是否存在毒力基因及毒力基因名稱：?+；????—???毒力基因名稱：????????
1.10血清抗原式：????????
1.11致病性(致瀉性大腸桿菌)：??ETEC；??EPEC；??EIEC；??EAEC；??STEC
1.12耐藥類型：????????
1.13采樣前是否使用抗生素及抗生素類型：??是；???否???抗生素類型：????????
1.14是否接種過相關菌株的疫苗：???是；???否